Учёные «Вектора» создали ИИ для подбора терапии ВИЧ

Специалисты российского центра вирусологии «Вектор» разработали модели машинного обучения, которые определяют тропность штаммов ВИЧ-1. Этот показатель влияет на выбор препарата для пациента и скорость развития болезни.

«Мы оценили существующие инструменты для генотипического предсказания тропности, создали свою, которая валидирована для российских штаммов. Ранее этого никто не делал, потому что не было генотипированных последовательностей, не было интереса у иностранных коллег. Также реализовали наши модели в виде пользовательского графического интерфейса, чтобы сделать ее удобной в будущем, возможно, для использования специалистами в клинической отрасли», — сообщили исследователи.

Сейчас надёжно определить тропность можно только в лаборатории, работая с живым вирусом. Это дорого, долго и доступно немногим лабораториям. Генотипические методы дешевле и быстрее, но существующие программы плохо подходят для вариантов вируса, распространённых в России. Учёные «Вектора» обучили свои алгоритмы на 13 тысячах последовательностей, часть из которых исследовали сами, а часть взяли из открытой базы данных. В результате точность для одного российского варианта выросла примерно на 10%, а для второго достигла 90% на данных, которые модель раньше не видела. Инструмент впервые проверен именно на российских штаммах и реализован в виде удобного графического интерфейса.

Подписывайтесь на наш Telegram-канал, чтобы быть в курсе всех новостей и событий Рунета.